阅读以下关于Java企业级应用系统开发架构选择方面的叙述，在回答问题 1至问题3。
某软件公司承担了某中小型企业应用软件开发任务，进度要求紧迫。为了按时完成任务，选择合适的企业应用系统开发架构非常重要。项目组在进行方案论证时，项目组成员提出了两种开发思路。
(1)刘工建议采用J2EE 5.0和EJB 3.0进行开发。理由是J2EE定义了标准的应用开发体系结构和部署环境，EJB是J2EE的基础和核心。J2EE 5.0主要目标是简化开发，相比EJB 2.1，EJB 3.0具有很多改进和提高。
(2)杜工建议采用Struts，Spring和Hibernate轻量级开源框架相结合的方式。理由是随着Java开源项目阵营的发展壮大，一些基于POJOs (Plan Old Java Objects)的开源框架被广泛地引入到Java企业应用开发中来，与重量级的EJB框架相比，这些轻量级的框架有很多优点。
项目组仔细比较分析了两种方案的特点、优点和不足之处。认为杜工和刘工的建议都合理，但是从结合当前项目实际情况出发，最后决定采用杜工的建议。
Java企业应用框架一般被划分为三个层次，请用150字以内文字说明都有哪三个层次?功能分别是什么?