在股商存管业务中，根据分行业务角色的不同分为主办行与协办行，对应的BGL账户也分为主办行BGL账户和协办行BGL账户。
主办行BGL账户除了作为主办行辖内出入金的临时存欠账户外，还承担日终资金归集并与交易所托管账户之间资金清算划转的作用。
协办行BGL账户的主要作用是在该一级分行辖内发生出入金交易的临时存欠账户，日终核对无误后归集至主办行BGL账户
股商存管BGL账户采用自动记账方式时，跨行标识参数应设置为“不限制”；如在特殊情况下（如出现单边帐情况），股商存管BGL账户采用由网点实体柜员完成人工记账方式时，原则上仅允许本机构柜员操作，不允许跨机构操作